| author's research project Dr. Eduard V. Mychko

RAUPOLOGY v.0.9.1 (beta)

RAUPOLOGY v.0.9.1 (beta)

This program is a tool for analyzing the geometry of plano-spiral (ie, folded into a flat spiral) shels, as well as statistical processing of the results of such studies.

OSArchiveSize
Windows 64rar27,3 MbDownload
Windows 32rar22,5 MbDownload
Linux 64rar29,3 MbDownload
Linux 32rar30,4 MbDownload
MacOs 64rar29 MbDownload
MacOs 32rar28,1 MbDownload

Основу современного понимания разнообразия конструктивных особенностей планоспиральных раковин цефалопод заложили работы американского теоретика палеонтологии Д. Раупа (почитать о методе можно, например, в соответствующей главе учебника: Основы палеонтологии. Рауп Д., Стэнли С.). Им предложен простой и визуально наглядный способ характеристики таких раковин по трем измеряемым параметрам: скорости расширения оборотов, форме образующей кривой и пропорции поперечного сечения оборотов. Раупом показано теоретически возможное разнообразие планоспиральных раковин и его частную реализацию у аммоноидей. При разработке своего метода Рауп опирался на следующие соображения:в общем случае, раковины аммоноидей завиваются по логарифмической спирали, а следовательно, их форма может быть проанализирована математически;

  • необходимые параметры могут быть измерены непосредственно
  • на раковине или на её фотографическом изображении.

Для того, чтобы избежать неудобного измерения углов переносов оборотов и некоторых других сложных вычислений Рауп ввел пять параметров, отношения которых адекватно описывают форму спирали и раковины.

Вне зависимости от выбранного подхода функциональной интерпретацииморфологических параметров раковины для подобных исследований требуетсядовольно большая подготовительная работа. Съем размеров с раковин, составление таблиц и вычисление "рауповских" параметров, составление графиков и диаграмм. Нами была поставлена задача максимально облегчить и сократить сбор первичных данных и проведение вычислений.Компьютерные программы такого рода уже некоторое время используются исследователями аммоноидей, однако имеют определенные недостатки. Многие из них написаны достаточно давно, на неактуальных сегодня языках программирования, и плохо совместимы с современными операционными системами. Кроме того, как правило, такие программы рассчитаны на решение одной частной задачи, конкретного исследователя или коллектива, и не включают весь комплекс необходимых процедур.

v.0.9 - first beta-version of the program, written in VB6 in 2012, is not supported

v.0.9.1 - beta-version of the program, 2015, rewritten to the technology js, added a new functionality, dramatically changed algorithms

The program is a cross-platform node-webkit application. The application is written in JavaScript, the user interface is created using HTML5+CSS3.

The platforms, libraries and plugins are used:

  • node.js
  • jQuery
  • D3.js
  • d3.geom.contour.js
  • jquery.noty.js
  • jquery.mCustomScrollbar.js

The work is supported by the federal target program "Scientific and Scientific Pedagogical Staff of Innovative Russia" for 2009-2013 by lot "Conducting scientific research by teams of scientific and educational centers in the field of general biology and genetics" (theme: "Formation of skeletal organisms and ecological structure of marine communities").

Publications of authors on this topic

  • Boyko M.S., Mychko E.V. The ‘Raupologiya’ software based on the chonchometrical method of D. Raup. Modern problems of researching cephalopods. Morphology, systematics, evolution, ecology and biostratigraphy. Proceedings of the meeting (Moscow, 9 - 11 April 2012), eds. T.B. Leonova, I.S. Barskov, V.V. Mitta. PIN RAS, 2012, 125 p. [in Russian]
  • Boyko M.S., Mychko E.V. The ‘RAUPOLOGY’ program – instrument for morphometric study of ammonoid shell. Bulletin MOIP, Geology section, 2012, Volume 87, Issue 6, pp. 49-56 [in Russian]